फ्लोरोसेंट रंग विशेष संरचनाओं वाले यौगिक हैं, और उनकी संरचनात्मक विशेषताओं में मुख्य रूप से निम्नलिखित तीन बिंदु शामिल हैं:
(1) अणु में फ्लोरोसेंट उत्सर्जक समूह होता है, जैसे कार्बोनिल समूह, नाइट्रोजन-नाइट्रोजन डबल बॉन्ड, कार्बन-नाइट्रोजन डबल बॉन्ड आदि।
(2) अणु में ऑक्स्रोम समूह होते हैं। ऑक्सोक्रोम समूह स्पेक्ट्रम को लाल बदलाव करता है और फ्लोरेसेंस दक्षता को बढ़ाता है, जैसे प्राथमिक अमीनो समूह, माध्यमिक अमीनो समूह, हाइड्रोक्सिल समूह, ईथर बॉन्ड, एमीड ग्रुप आदि।
(3) अणु में एक कठोर प्लानर संरचना के साथ संयुग्मित π बंधन होते हैं । इंट्रामोल्यूलर संयुव प्रणाली जितनी बड़ी होगी, प्लैनेसिटी उतनी ही मजबूत होगी, फ्लोरेसेंस तीव्रता उतनी ही अधिक होगी। कुछ कारक जो संाधीनता की डिग्री में सुधार कर सकते हैं, फ्लोरेसेंस दक्षता को बढ़ा सकते हैं और फ्लोरेसेंस तरंगदैर्ध्य को लंबी लहर की दिशा में स्थानांतरित कर सकते हैं।
